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电泳结果重复性差?从样品到仪器的6大关键因素分析

作者:六一生物 发布时间:2025-06-13 09:14:12 点击:
    精心设计的实验,重复操作却得到不同的电泳结果,条带位置、亮度差异明显,这让不少科研工作者和实验人员头疼不已。电泳结果重复性差不仅浪费时间和样品,还可能导致错误的实验结论。其实,追根溯源,问题往往出在从样品制备到仪器操作的多个环节。下面就为你深度剖析影响电泳结果重复性的6大关键因素,并给出针对性解决办法。

一、样品制备:一切误差的源头

问题表现

相同样品不同批次电泳,条带位置、清晰度不一致;同一样品分装后电泳,结果差异显著。某实验室在进行蛋白质电泳时,两次提取的同一组织样品,条带分布和强度完全不同。

原因分析

1. 样品提取过程差异:不同操作人员提取样品时,手法、时间、试剂用量存在差异。比如提取核酸时,研磨组织的力度和时间不同,会导致核酸片段大小不一,影响电泳迁移率。
2. 样品保存不当:样品在储存过程中发生降解或变质。例如,蛋白质样品反复冻融,导致蛋白质结构破坏;核酸样品未在低温下保存,被核酸酶污染降解。
3. 样品浓度不均:未准确测定样品浓度,或稀释过程出现误差,使得上样时样品实际含量不同,进而影响条带的亮度和位置。

解决办法

1. 标准化提取流程:制定详细的样品提取SOP(标准操作程序),确保每位实验人员严格按照流程操作。对新入职人员进行专项培训,统一操作手法和时间。
2. 优化储存条件:根据样品性质选择合适的储存条件。蛋白质样品分装后,置于-80℃冰箱保存,避免反复冻融;核酸样品加入RNase抑制剂,储存于-20℃环境,且使用无酶容器。
3. 精准浓度测定:使用可靠的浓度测定方法,如核酸用分光光度计测定260nm吸光值,蛋白质采用Bradford法或BCA法。每次测定重复3次,取平均值,确保浓度准确。上样前,再次核对样品浓度并进行必要稀释。

二、试剂质量:被忽视的“隐形杀手”

问题表现

更换试剂批次后,电泳结果明显改变;同一瓶试剂使用一段时间后,电泳效果变差。某科研团队更换电泳缓冲液后,核酸条带出现严重拖尾现象。

原因分析

1. 试剂纯度不足:购买的试剂纯度不达标,含有杂质,影响分子在电泳中的迁移。例如,低纯度的琼脂糖会导致凝胶孔径不均,条带分离效果差。
2. 试剂配制误差:自行配制试剂时,原料称量不准确、溶剂比例不当,或配制过程污染。像缓冲液pH值偏差,会改变分子带电状态,影响迁移率。
3. 试剂保存问题:试剂储存条件不当,导致变质。如聚丙烯酰胺储存过久发生聚合,无法形成正常凝胶结构;电泳染料过期,染色效果不稳定。

解决办法

1. 选择优质试剂:优先采购知名品牌、质量有保障的试剂,查看试剂纯度标识和保质期。对于关键试剂,如琼脂糖、聚丙烯酰胺,进行预实验测试质量。
2. 规范试剂配制:严格按照配方配制试剂,使用高精度称量仪器和移液设备。配制过程在洁净环境中进行,避免污染。配制完成后,标记试剂名称、浓度、配制时间和保质期。
3. 合理储存试剂:根据试剂性质选择储存条件,如避光、低温、防潮等。对易变质试剂,如过硫酸铵、TEMED,小剂量分装储存,使用时按需取用,避免频繁开盖。定期检查试剂状态,过期或变质试剂及时更换。

三、凝胶质量:条带分离的基础

问题表现

不同批次制备的凝胶,电泳结果差异大;同一块凝胶上,条带迁移速度和清晰度不一致。某次实验中,同一凝胶板上部分条带清晰,部分却模糊拖尾。

原因分析

1. 凝胶浓度和交联度波动:配制凝胶时,溶质(琼脂糖或聚丙烯酰胺)和交联剂用量不准确,导致凝胶孔径大小不一,影响分子迁移。
2. 凝胶凝固不均匀:倒胶过程中桌面不平、环境震动,或凝胶混合不充分,使凝胶局部浓度不同。例如,凝胶边缘和中间凝固程度有差异,条带迁移速度就会不同。
3. 凝胶老化:凝胶放置时间过长,会发生脱水收缩,孔径变小,影响分子迁移。同时,凝胶中水分流失,会导致电阻增大,电泳时产热增加,影响条带质量。

解决办法

1. 精准控制凝胶配比:使用电子天平精确称量溶质和交联剂,用量筒或移液枪准确量取溶剂。每次配制凝胶前,校准称量仪器和移液设备,确保比例准确。
2. 优化倒胶操作:选择平稳桌面倒胶,倒胶过程保持匀速,避免震动。倒胶后,让凝胶在水平、恒温、恒湿环境中自然凝固,琼脂糖凝胶一般静置30 - 40分钟,聚丙烯酰胺凝胶静置1 - 2小时。
3. 现用现配凝胶:尽量在使用前制备凝胶,避免长时间放置。若需提前制备,将凝胶浸泡在缓冲液中,4℃保存,且存放时间不超过24小时。使用前,检查凝胶是否有脱水、干裂等老化现象,如有则重新制备。

四、电泳条件:结果稳定的关键

问题表现

相同样品在不同电泳条件下,条带迁移率和分离效果不同;连续多次电泳,结果逐渐变差。如电压不稳定时,核酸条带出现扭曲、变形。

原因分析

1. 电压和电流波动:电泳仪电源不稳定,电压或电流输出异常,导致分子迁移速度不稳定。实验室电路负载过大,也会影响电泳仪供电。
2. 电泳温度变化:电泳过程中温度升高,缓冲液黏度降低,电阻减小,电流增大,分子迁移速度加快,还可能引起蛋白质变性、核酸解链,影响结果重复性。
3. 电泳时间差异:电泳时间控制不准确,过长或过短都会影响条带分离效果。例如,电泳时间不足,分子未充分分离;时间过长,条带扩散、拖尾。

解决办法

1. 稳定电泳电源:使用稳压电源或UPS不间断电源,确保电泳仪供电稳定。避免与大功率设备共用同一电路,减少电压波动影响。定期检查电泳仪电源模块,发现问题及时维修或更换。
2. 控制电泳温度:使用带有冷却系统的电泳仪,将温度控制在合适范围(一般4 - 25℃)。若电泳仪无冷却功能,可在电泳槽周围放置冰袋降温,但要注意防止冷凝水进入电泳槽。
3. 精准控制电泳时间:根据样品性质、凝胶浓度和电泳电压,提前估算电泳时间。实验过程中,加入示踪染料(如溴酚蓝)监测条带迁移进度,当染料迁移到合适位置时,及时停止电泳。每次实验记录电泳时间和条件,便于后续重复。

五、仪器维护:被低估的重要环节

问题表现

电泳仪使用一段时间后,电泳结果变差;不同仪器对相同样品的电泳结果不一致。某实验室两台电泳仪跑同一样品,条带迁移率相差明显。

原因分析

1. 电极污染和老化:电极长期使用后,表面被氧化、污染,电阻增大,影响电流传导。铂金丝电极生锈、变黑,会导致电压不稳,条带迁移异常。
2. 电泳槽残留杂质:电泳槽清洗不彻底,残留缓冲液、样品杂质,污染后续实验。这些杂质会影响凝胶的导电性和分子迁移环境,导致结果不稳定。
3. 仪器部件磨损:电泳仪内部的导线、开关等部件长期使用后磨损,接触不良,影响仪器正常工作。例如,开关接触不良会导致电泳过程中突然断电。

解决办法

1. 定期维护电极:每次实验后,用蒸馏水冲洗电极,去除表面杂质。若电极氧化,将其浸泡在30%硝酸溶液中5 - 10分钟(操作时做好防护),然后用蒸馏水冲洗干净、晾干。定期检查电极电阻,电阻过大时及时更换。
2. 彻底清洁电泳槽:实验结束后,立即用清水冲洗电泳槽,去除残留缓冲液和样品。每周用专用清洁剂(如中性洗涤剂)彻底清洗一次,再用蒸馏水冲洗干净。避免使用强酸碱清洁剂,防止腐蚀电泳槽。
3. 全面检查仪器:每月对电泳仪进行一次全面检查,包括导线连接、开关功能、电源输出等。发现部件磨损或故障,及时维修或更换。建立仪器维护档案,记录每次维护时间、内容和结果。

六、操作规范:细节决定成败
问题表现
同一实验不同人员操作,电泳结果不同;实验操作步骤混乱,导致结果不稳定。如加样时操作不当,样品溢出或未加准确量。

原因分析

1. 操作手法不统一:不同实验人员加样、安装凝胶等操作手法存在差异,影响实验重复性。例如,加样时吸头插入深度、加样速度不同,会导致样品在凝胶中分布不均。
2. 步骤遗漏或错误:实验过程中遗漏关键步骤,如忘记加入电泳缓冲液、未校准电泳仪参数等;或操作顺序错误,影响实验结果。
3. 环境因素干扰:实验环境不稳定,如温度、湿度变化,静电干扰等,对电泳结果产生影响。例如,在干燥环境中,静电会导致凝胶吸附灰尘,影响条带观察。

解决办法

1. 强化操作培训:对实验人员进行统一培训,规范操作手法和流程。制作操作视频或手册,供实验人员随时参考学习。定期组织操作考核,确保每位人员熟练掌握规范操作。
2. 严格执行操作流程:制定详细的实验操作流程表,实验人员按表操作,每完成一步进行标记。设置双人核对环节,对关键步骤(如加样、参数设置)进行复查,避免遗漏或错误。
3. 优化实验环境:保持实验室温度、湿度稳定,安装空调和加湿器进行调节。使用防静电设备,如防静电工作台、防静电手套,减少静电干扰。定期清洁实验室,保持环境整洁。

电泳结果重复性差是多种因素共同作用的结果。从样品制备到仪器操作的每个环节都不容忽视。通过对这6大关键因素的分析和针对性改进,相信你能有效提升电泳实验的重复性和准确性。在实验过程中,你还遇到过哪些影响电泳结果的难题?欢迎在评论区交流分享,一起攻克实验难关! 


本文由北京六一生物编辑整理。

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