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- DYCZ-20F在SSCP分析中的应用,精准检测基因点突变的利器
- DYCZ-20F测序胶优化艺术,如何将读长与清晰度推向极限
- DYCZ-20F测序电泳仪操作避坑全攻略:从手忙脚乱到一次点亮清晰序列
- 打开新视野:DYCZ-30C在非变性电泳与EMSA中的华丽转身
- 如何驾驭DYCZ-30C实现SDS-PAGE蛋白条带的极致锐利
- DYCZ-30C双板夹芯垂直电泳仪操作避坑指南:我的血泪史与完美制胶秘籍
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DYCZ-20F在SSCP分析中的应用,精准检测基因点突变的利器
作者:六一生物
发布时间:2025-11-27 09:07:24
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你以为DYCZ-20F只能用于桑格测序?那就太小看它了。通过巧妙的“模式切换”,它能够变身为一台高分辨率的SSCP分析仪,无需测序即可快速、低成本地筛查基因点突变,在遗传病研究和癌症诊断中大显身手。
我们的课题涉及筛查一个肿瘤相关基因的点突变。面对大量样本,全测序成本高昂且耗时。当我在文献中看到SSCP(单链构象多态性)技术时,我立刻想到了闲置的DYCZ-20F——它那精密的温控系统和均匀的电场,不正是进行SSCP分析的理想平台吗?
一、方案改造:从变性世界到非变性世界
SSCP分析的核心是:在非变性条件下,单链DNA会形成独特的空间构象,一个碱基的突变就会改变其构象,进而导致在凝胶中的迁移速率发生变化。
二、核心改造:
1. 去除尿素: 配制6%-8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶,凝胶和电泳缓冲液中均不添加尿素和SDS。
2. 更换缓冲液: 使用0.5x或1x TBE作为电泳缓冲液。
3. 取消加热: 这是与测序电泳最根本的区别。SSCP分析必须在低温(4-10℃) 下进行,以维持单链DNA构象的稳定。
三、我的实战流程与案例:
目的: 筛查一批肺癌细胞样本中TP53基因外显子的突变。
样本处理: 通过PCR扩增目标外显子,然后将PCR产物进行变性处理(95℃加热5分钟,立即冰浴),使其双链打开成为随机卷曲的单链。
四、电泳条件:
1、将DYCZ-20F放置在4℃冷房中。
2、设置低功率恒功率电泳(例如8-10W),以确保凝胶在低温下运行,防止产热导致构象改变。
3、电泳时间较长,通常需要4-6小时,直到溴酚蓝跑至胶板底部。
五、结果判读与发现:
1、在银染后的凝胶上,野生型样本通常呈现两条清晰的条带(代表正义链和反义链)。
2、当我在某个样本的泳道中,看到了与野生型迁移位置明显不同的异常条带模式时,我心里的警报响了。 这强烈提示该样本中存在点突变。
3、后续我们对这个异常样本进行了测序验证,果然发现了一个确切的错义突变。
六、思考与价值:
这次成功的“跨界”应用,让我们团队建立了一套高效、低成本的突变初筛方案。大批量样本先经DYCZ-20F进行SSCP分析,只对异常样本进行测序确认,极大地节约了时间和经费。
它让我深刻地认识到,一台优秀的仪器,其价值远不止于说明书上的那几项功能。当你真正理解了技术原理,你就获得了重新定义仪器用途的能力。 DYCZ-20F不仅是测序仪,更是一个强大的核酸构象分析平台,等待着我们去发掘它更多的潜能。
本文由北京六一生物编辑整理。
北京六一生物科技有限公司创建于1970年,50多年的历史,公司先后3次承担电泳装置产品国家、行业标准的起草、修订工作,2009年负责《基础电泳装置》国家标准已发布实施。专业生产生物化学与分子生物学检验分析仪器的科技型国有企业。
主要生产包含电泳仪、紫外分析仪、凝胶成像分析系统、酶标仪、化学发光成像系统、基因扩增仪等检验分析设备。
如果您对我们的产品有任何问题,欢迎您的来电:400 960 6117
我们的目标是:做生物化学分析仪器行业海尔
我们的课题涉及筛查一个肿瘤相关基因的点突变。面对大量样本,全测序成本高昂且耗时。当我在文献中看到SSCP(单链构象多态性)技术时,我立刻想到了闲置的DYCZ-20F——它那精密的温控系统和均匀的电场,不正是进行SSCP分析的理想平台吗?
一、方案改造:从变性世界到非变性世界
SSCP分析的核心是:在非变性条件下,单链DNA会形成独特的空间构象,一个碱基的突变就会改变其构象,进而导致在凝胶中的迁移速率发生变化。
二、核心改造:
1. 去除尿素: 配制6%-8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶,凝胶和电泳缓冲液中均不添加尿素和SDS。
2. 更换缓冲液: 使用0.5x或1x TBE作为电泳缓冲液。
3. 取消加热: 这是与测序电泳最根本的区别。SSCP分析必须在低温(4-10℃) 下进行,以维持单链DNA构象的稳定。
三、我的实战流程与案例:
目的: 筛查一批肺癌细胞样本中TP53基因外显子的突变。
样本处理: 通过PCR扩增目标外显子,然后将PCR产物进行变性处理(95℃加热5分钟,立即冰浴),使其双链打开成为随机卷曲的单链。
四、电泳条件:
1、将DYCZ-20F放置在4℃冷房中。
2、设置低功率恒功率电泳(例如8-10W),以确保凝胶在低温下运行,防止产热导致构象改变。
3、电泳时间较长,通常需要4-6小时,直到溴酚蓝跑至胶板底部。
五、结果判读与发现:
1、在银染后的凝胶上,野生型样本通常呈现两条清晰的条带(代表正义链和反义链)。
2、当我在某个样本的泳道中,看到了与野生型迁移位置明显不同的异常条带模式时,我心里的警报响了。 这强烈提示该样本中存在点突变。
3、后续我们对这个异常样本进行了测序验证,果然发现了一个确切的错义突变。
六、思考与价值:
这次成功的“跨界”应用,让我们团队建立了一套高效、低成本的突变初筛方案。大批量样本先经DYCZ-20F进行SSCP分析,只对异常样本进行测序确认,极大地节约了时间和经费。
它让我深刻地认识到,一台优秀的仪器,其价值远不止于说明书上的那几项功能。当你真正理解了技术原理,你就获得了重新定义仪器用途的能力。 DYCZ-20F不仅是测序仪,更是一个强大的核酸构象分析平台,等待着我们去发掘它更多的潜能。
本文由北京六一生物编辑整理。
北京六一生物科技有限公司创建于1970年,50多年的历史,公司先后3次承担电泳装置产品国家、行业标准的起草、修订工作,2009年负责《基础电泳装置》国家标准已发布实施。专业生产生物化学与分子生物学检验分析仪器的科技型国有企业。
主要生产包含电泳仪、紫外分析仪、凝胶成像分析系统、酶标仪、化学发光成像系统、基因扩增仪等检验分析设备。
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