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DYCP-31E 自动染色与高效回收方案详解

作者:六一生物 发布时间:2025-12-25 09:07:01 点击:
DYCP-31E本身无内置自动染色模块,需通过“预制胶内染+槽内/槽外自动化染色方案”实现自动染色;依托桥式结构、可拆卸电极与适配工具,搭配试剂盒或电洗脱,可实现核酸高效回收,兼顾速度与纯度。以下是具体实现路径与操作要点。
 
一、自动染色:从“手动浸泡”到“流程自动化”

核心思路:制胶时预混染料实现“电泳即染色”,或用槽体/外接设备完成自动化染色,减少手动操作与时间。

1. 预制胶内染(最适配的“电泳同步染色”)

这是DYCP-31E最简便的自动染色方式,无需额外步骤,电泳结束即可成像。

 
  1. 操作要点:琼脂糖加热溶解后冷却至60℃,按比例加入SYBR Green、GoldView等核酸染料(如100mL胶液加5μL 10000×染料),混匀后倒入配套制胶器,制胶后上样电泳。
  1. 优势:桥式结构缓冲液用量少(约1000mL),染料扩散少,条带均匀;槽体透明可实时观察,开盖断电保障安全。
  1. 注意:染料避光保存,避免紫外照射分解;小片段(<500bp)可适当提高染料浓度,增强条带亮度。
2. 槽内自动染色(电泳后直接启动,无需移胶)

利用槽体与外接摇床联动,实现电泳后自动染色,减少移胶污染。
  1. 电泳结束后断开电源,保留槽内缓冲液,加入稀释好的快速染料(如1000mL缓冲液加50μL 1000×染料),轻轻混匀。
  1. 盖上槽盖,将电泳槽置于摇床,50-80rpm低速振荡10-15分钟(适配QuickBlue等快速染液)。
  1. 倒掉染色缓冲液,用蒸馏水冲洗1-2次,即可紫外成像。
  1. 适配性:聚碳酸酯槽体耐化学腐蚀,无渗漏,适合槽内染色;可拆卸电极方便后续清洗,避免染料残留。
3. 外接自动染色仪联动(高通量场景)

搭配自动染胶仪(如六一配套染胶系统),实现“电泳-染色-清洗”全流程自动化。
  1. 流程:电泳结束后,通过适配支架将凝胶托盘移至染色仪,预设程序(染色15min→清洗2次×5min),自动完成后直接进入成像,适合96孔批量样本处理。
  1. 优势:排枪适配的34齿试样格与自动染色仪匹配,批量处理效率提升3倍,减少人为误差。
 
二、高效回收:从电泳优化到回收方法适配,回收率提升至80%+

1. 电泳参数优化:为回收铺垫高质量条带
  1. 凝胶选择:小片段(100bp-1kb)用2.0%琼脂糖,大片段(1-10kb)用0.8%,提升条带分辨率,便于精准切胶。
  1. 电压控制:恒压80-100V,避免电压过高导致条带扩散;TAE缓冲液适配长时电泳,TBE适合高分辨率分离,缓冲液最多回收2次。
  1. 上样量:控制单孔上样量(DNA≤500ng),避免条带过载导致拖尾,影响回收纯度。
2. 三种高效回收方法(适配不同场景)

方法1:试剂盒胶回收(常规首选,回收率70%-90%)
  1. 紫外灯下快速切取目标条带(仅保留条带区域,减少胶块体积),放入离心管,称重记录。
  1. 加入3倍体积溶胶液(如Buffer GM),50℃水浴5分钟,期间颠倒混匀,确保胶块完全溶解。
  1. 按试剂盒说明过柱、洗涤、洗脱(洗脱液预热至50℃,体积30-50μL),提高回收率。
  1. 适配性:DYCP-31E的精准制胶器保障条带均一,切胶更精准,减少胶块浪费,提升回收纯度。
方法2:电洗脱回收(大片段/高纯度需求,回收率80%+)

利用DYCP-31E的稳定电场,搭配电洗脱装置实现高效回收。
  1. 电泳后切取目标条带,放入透析袋,加入少量缓冲液,置于电洗脱槽,设置恒压60-80V,洗脱30-60分钟(片段越大,时间越长)。
  1. 回收透析袋内液体,用酚-氯仿抽提或试剂盒纯化,去除杂质。
  1. 优势:高纯铂金电极(≥99.95%)电场均匀,减少片段扩散,电洗脱后片段完整性好,适合质粒、大片段DNA制备。
方法3:槽内直接回收(微量样本,快速简便)

针对少量样本,利用桥式结构缓冲液少的特点,实现快速回收。
  1. 电泳结束后,定位目标条带位置,用移液器在条带对应槽底区域吸取缓冲液(避免吸到凝胶碎片)。
  1. 加入核酸浓缩柱(如Amicon Ultra-0.5),14000g离心5分钟,浓缩回收样本,适合紧急验证场景。
  1. 注意:缓冲液用量少(1000mL),回收时避免污染,可先标记条带位置再操作。
 
三、关键优化与故障排除

 
目标 优化要点 故障排除
染色均匀 内染时染料混匀,槽内染色低速振荡 条带模糊:降低电压至80V,延长染色时间;无荧光:更换新染料,检查成像参数
回收高效 精准切胶,溶胶彻底,洗脱液预热 回收率低:胶块未完全溶解→延长水浴时间;洗脱体积过大→减少至30μL
避免污染 可拆卸电极彻底清洗,染色后蒸馏水冲洗 交叉污染:制胶器与托盘分开清洗,电泳槽用75%酒精擦拭消毒
 
四、应用场景与参数推荐

 
场景 染色方案 回收方法 推荐参数
PCR产物验证 预制胶内染 试剂盒回收 胶浓度1.5%,电压100V,洗脱体积30μL
质粒提取鉴定 槽内快速染色 电洗脱 胶浓度0.8%,电压80V,洗脱60分钟
高通量筛查 自动染色仪联动 批量试剂盒回收 34齿试样格,染色15min,回收按96孔批量处理

需要我结合你的样本类型(如PCR产物/质粒/大片段DNA),定制一份包含染色浓度、回收方法、参数设置的可直接套用SOP吗?



本文由北京六一生物编辑整理。

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